В школе-интернате особое внимание уделено медицинскому обслуживанию детей. Для улучшения качества медицинской службы создан медицинский блок. Медицинский блок состоит из следующих кабинетов: приёмная узких специалистов, кабинет массажа, процедурный кабинет, кабинет физиотерапии, изолятор на 1 койку.
Медицинская служба школы-интерната представлена следующими специалистами: заведующая медслужбой, невролог, педиатр, психиатр, ортопед-травматолог, постовые медицинские сёстры, массажист, инструктор ЛФК.
Медицинская деятельность в школе-интернате осуществляется в соответствии с Лицензией на осуществление медицинской деятельности (№ ЛО-73-01-000913 от 19.07.2013 года ).